Raittiuden Ystävien hallinto on kolmiportainen. Ylin päättävä elin on varsinainen edustajakokous, joka kokoontuu touko-syyskuussa joka kolmas vuosi. Edustajakokouksen välivuosina kokoontuu Liittovaltuusto, jonka valtuutetut jäsenet valitaan edustajakokouksessa. Myös jäsenliitoilla on Liittovaltuustossa omat edustajansa. Järjestön toiminnasta ja taloudesta vastaa Raittiuden Ystävien hallitus, joka kokoontuu noin 10 kertaa vuodessa.
Raittiuden Ystävien puheenjohtajana on 1.1.2014 lähtien toiminut käsikirurgian dosentti, professori Martti Vastamäki.
Liittovaltuuston puheenjohtajana on 1.1.2014 lähtien toiminut Huittisten kaupungin nuoriso- ja liikuntatoimenjohtaja Teuvo Munkki.
Järjestön toiminnanjohtajana aloitti 15.11.2022 pitkän linjan nuoriso- ja järjestövaikuttaja Hannah Honkanen.
Hallitus
puheenjohtaja Martti Vastamäki, Kaarina
Kari Aaltonen, Hauho
Matti Järviharju, Kauhajoki
Jaakko Korpela, Salo
Hanna-Kaisa Lähde, Kotka
Tuomas Rouvila, Porvoo
Matti Sallinen, Helsinki
Joni Villanen, Porvoo
Harri Saine, Pori (varajäsen)
Tiina Sundqvist, Mäntsälä (varajäsen)
Liittovaltuusto 2021-2023
puheenjohtaja Teuvo Munkki, Säkylä
varapj. Matti Järviharju, Kauhajoki
Eila Iivari, Hollola
Jaakko Korpela, Salo
Eila Kotola, Virolahti
Matti Sallinen, Helsinki
Anni Siivonen, Lahti
Valto A. Meriläinen, Kristillinen terveys- ja raittiusjärjestö